سازمان هواپیمایی ابتدا اطلاعیه ستاد کل نیروهای مسلح – که صبح امروز منتشر شده بود – را جایگزین اطلاعیه خود کرد و پس از آن، سایت از دسترس خارج شد.
اکنون در رسانه‌های جریان اصلی و همچنین شبکه‌های اجتماعی، اطلاعیه‌ای از سازمان هواپیمایی کشوری دست به دست می‌شود؛ این در حالی است که پایگاه اطلاع رسانی این سازمان از دسترس خارج شده است و سخنگوی سازمان نیز انتشار هر گونه اطلاعیه را تکذیب می‌کند.
بر اساس گزارش رسانه‌ها، در این اطلاعیه آمده بود: «مسئول بررسی سانحه در اولین فرصت هماهنگی لازم با مراجع ذیربط را انجام داده و تأییدیه عدم انجام هرگونه عملیات نظامی را در مرکز کشور دریافت نموده است و متأسفانه علی رغم پیگیری های متعدد و مکرر سازمان هواپیمایی کشوری، تا زمان صدور اطلاعیه ستاد کل نیروهای مسلح، هیچگونه اطلاع رسانی در خصوص موضوع اصابت موشک سامانه‌های پدافند به هواپیمای مسافربری کشور اوکراین، به این سازمان صورت نپذیرفته است».
رسانه‌ها به نقل از سازمان هواپیمایی کشوری آورده اند: «با توجه به اطلاعات رادار تقرب فرودگاه مهرآباد تاکنون هیچگونه انحراف پروازی از سوی هواپیمای سانحه دیده به اثبات نرسیده است ، البته این موضوع باید با استفاده از اطلاعات جعبه‌های سیاه هواپیما نیز مورد تایید قرار گیرد».
بر اساس گزارش رسانه‌ها، در این اطلاعیه آمده است: «شایان ذکر است پرواز مذکور در قالب کریدورهای استاندارد و مورد تایید شبکه یکپارچه پدافند کشور (طرح خروجی IKA1A) در حال پرواز بوده است و هیچ مشکلی برای کنترل هواپیما از سوی خلبان گزارش نشده است.»